Berdasarkan Peraturan Menteri Energi dan Sumber Daya Mineral Nomor 13 Tahun 2016 Tentang Organisasi dan Tata Kerja Kementerian Energi dan Sumber Daya Mineral, Tugas Fungsi Sekretariat Badan Geologi sebagai berikut :

Tugas :

Sekretariat Badan Geologi mempunyai tugas melaksanakan koordinasi penyusunan kebijakan teknis dan pelaksanaan tugas, pembinaan dan pemberian dukungan administrasi kepada seluruh unit organisasi di lingkungan Badan Geologi.

Fungsi :

1. koordinasi pelaksanaan kegiatan dan penyusunan kebijakan teknis Badan Geologi;
2. koordinasi dan penyusunan rencana, program dan anggaran, pengelolaan dan pelayanan informasi, evaluasi dan laporan serta akuntabilitas kinerja;
3. koordinasi dan pengelolaan kepegawaian, penataan organisasi dan ketatalaksanaan, pelaksanaan manajemen perubahan, serta pengelolaan jabatan fungsional;
4. pengelolaan administrasi keuangan, perbendaharaan, pengelolaan barang milik negara, dan akuntansi;
5. pengelolaan urusan ketatausahaan, kearsipan, kerumahtanggaan, pengelolaan dokumentasi dan perpustakaan, barang milik negara, urusan hukum dan hubungan masyarakat, pengelolaan hak kekayaan intelektual, kerja sama, serta pengadaan barang/jasa; dan
6. pembinaan jabatan fungsional penyelidik bumi dan pengamat gunungapi.

Struktur Organisasi

Sekretariat Badan Geologi terdiri atas:

1. Bagian Rencana dan Laporan;
   
2. Bagian Kepegawaian dan Organisasi;
   
3. Bagian Keuangan; dan
   
4. Bagian Umum.